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Ubuntu WSL 环境下 LAMMPS 及 KOKKOS CUDA 软件包编译安装规程 🚀
本规程旨在详细说明在 Windows Subsystem for Linux (WSL) 的 Ubuntu 环境中，从源码编译并安装大规模原子/分子并行模拟器 (LAMMPS) 的步骤。重点介绍启用 KOKKOS 软件包以支持基于 NVIDIA CUDA 技术的图形处理器 (GPU) 加速功能，同时
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GROMACS 中 `pull` 命令与 `comm-grps` 参数的协同问题探讨
1. 背景：非平衡模拟中的挑战 在分子动力学模拟中，尤其是非平衡分子动力学（NEMD）模拟，我们常常需要对系统的特定部分施加外力或约束，以研究其在受迫条件下的行为。GROMACS 的 pull 代码就是一个强大的工具，常用于模拟牵引、压缩、剪切或像本案例中模拟活塞（移动壁）驱替流体的过程。 本案例涉
使用PoreMS进行创建多种类孔隙的研究过程笔记
PoreMS 基本介绍 PoreMS 是一个专为催化化学领域设计的开源库，用于构建具有各种形状的石英孔隙结构的分子模型。它的强大之处在于能够对表面进行多种类型的修饰，在石油工程中，通过不同的修饰，可以实现对不同亲和力的分析。此外，PoreMS 还能创建复杂的分子隧道构型。 GitHub 链接： Gi
我的 AI 使用分配策略：告别 OpenAI 订阅，拥抱多元 API（这篇文章都是Gemini写的）
告别 OpenAI 订阅：降智风波下的无奈之举 相信很多朋友都和我一样，曾经是 OpenAI 的忠实拥趸，毕竟 ChatGPT 的横空出世确实惊艳了我们。然而，最近 OpenAI 的一些“降智”行为让我感到失望。更重要的是，即使是真正的家宽 IP，也存在被封号的风险。这让我不得不重新考虑我的 AI
自建安全稳定的VPS节点：从选购到配置全攻略
title: 自建安全稳定的VPS节点：从选购到配置全攻略 (2024最新)
date: 2024-07-26
tags: [VPS, 科学上网, 网络安全, 隐私保护, 代理] 在网络环境日益复杂的今天，拥有一个安全稳定的个人 VPS 节点变得越来越重要。本文将分享我自建 VPS 节点的完整过程，
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如何在同一 IP 下区分连接 Windows 主机和 WSL2 的 SSH 服务
当 WSL2 与主机共用同一 IP 时，连接到同一 IP 的 SSH 服务时，无法直接区分访问的是 Windows 主机还是 WSL2 环境。为了解决这一问题，可以采用以下几种方案： 方法一：使用不同端口区分 为 Windows 主机上的 SSH 服务使用另一个端口 修改 Windows 上 SSH
分子动力学模拟中的电荷配置教程
本文将介绍分子动力学 (MD) 模拟中的电荷配置的重要性，尤其是 RESP2 电荷的思想及其在计算中的应用。同时，我们将探讨如何在 Multiwfn 中计算 RESP2 电荷，并比较衡量分子极性的不同指标。 溶剂对溶质电荷分布的极化效应 在溶剂环境下，溶质的电荷分布会受到溶剂环境的极化影响。溶剂的介
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Jupyter 中的科学绘图总结
Jupyter 中的科学绘图总结 Jupyter Notebook 是进行科学计算和数据可视化的强大工具。本文总结了 Jupyter 中常用的科学绘图方法，以及如何使用第三方库来改进图表的外观。 1. 基础绘图库 Jupyter 中最常用的科学绘图库是 Matplotlib 和 Seaborn。 M